強(qiáng )納森是一名棄嬰,剛出生就被放置在孤兒院前,幸好一名船長(zhǎng )認養了他,並(bìng )供給(gěi )他唸寄宿學校。只是聰明但又調皮的強納森連續被五個學校退學,養父最後幫他找到一所「聖湯瑪士合唱寄宿學校」。強納森在(zài )機場見一隻狗被主人遺棄,便將牠帶往學校,但(dàn )因學校禁止養狗,在室友的建議下將小狗養在他們的秘密基地──一座以拖車蓋成的屋子。沒想到此時來了一名自稱是巴布(bù )的人,謂此(cǐ )處是(shì )他的產業。眾人無奈離去,但巴布似乎認得學校(xiào )教音樂的波克老師,遂答應照顧小狗,而且也歡迎眾人到「秘密基地」玩。
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